Troque apenas o comando.

Isso já vai dar um outro ar pra motoquinha e é facilmente reversivel. Sem contar que um bom comando não diminui em nada a vida util do motorzinho.

E bote um filtro esportive, não deixe sem.
Mas tenha em mente que filtro esportivo não combina com chuva. Ele enxarca, pois fica ao ar livre. O melhor é deixar o filtro original mesmo, ou adaptar o esportivo dentro da caixa de ar.