Não... Você perdeu a garantia da câmara, nada a ver com a moto, até pq, você teria que acionar a garantia da Pirelli para a câmara e não a Yamaha. Mas aí, como disse, se você fez um remendo na câmara, já perdeu a garantia dela, você poderia acionar a fábrica, mas qualquer produto para ter a garantia acionada, não pode ter sido alterado.
Em questão da troca do pneu, você não precisa trocar ele, foi apenas um furo, além do que, seu pneu usa câmara, então, você só precisa troca a câmara.
O ideal, mesmo sendo pequeno o furo do pneu, seria a troca da câmara por uma nova e também fazer o remendo do furo no pneu, com vulcanização, pois esse furo, mesmo que pequeno, pode ocasionar infiltração na carcaça do pneu e comprometer a segurança dele a longo prazo.