Eu tenho usado uma moto flex (mix) por quase 4 anos, o que posso dizer é que há vantagens sim.
Sob o aspecto prático, se houver variação de preços dos combustíveis você pode escolher qual quer usar, também pode misturar.. No etanol a moto fica com um gás a mais (pouco).. Porém às vezes o sistema da minha não funciona direito, não reconhece bem a mistura, ou demora pra reconhecer. Quando a moto era nova funcionava certinho, tanto que rodei com 100% etanol e era uma beleza. O único ponto negativo que notei foi esse. Talvez o defeito seja no sensor de oxigênio (lambda?) que fica perto no cabeçote, na saída de ar.
Já sob o técnico não posso falar. O que ouço dizer é que motor flex é um motor à álcool mexido pra funcionar também com gasolina, e não o oposto.
Minha moto tá com 51900km e o sistema de alimentação está normal até agora, o corpo da borboleta nunca foi tirado pra limpar nem nada..